本科於門診大樓二樓，設有專門的內視鏡室與超音波室為病患加以服務。

看診病症項目：腹脹、腹瀉、腹痛、大便不規則、食慾不振、胃酸不適、幽門桿菌感染、糞便顏色改變、吐血、肝臟機能異常等肝膽胰腸胃疾病。另有內視鏡減重手術（包括縮胃針注射與胃水球置放）等。

醫療設備項目：電子彩色上下消化道內視鏡 (含窄頻影像系統)、腹部彩色都卜勒超音波、內視鏡止血裝置 (含止血注射針、止血夾、氬氣電漿止血器)、息肉切除裝置、經內視鏡靜脈瘤結紮裝置、膽胰管內視鏡(含取石裝置、碎石裝置、塑膠與金屬支架置放器具)、食道擴張裝置、肝臟切片裝置、胃造廔裝置做檢查與手術處置。另有內視鏡清洗機與血壓血氧濃度監測儀做清潔消毒與生命跡象監測。