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政府為使國軍退除役官兵，身罹疾患榮民獲得適當適時之醫療，俾能早日康復，轉而就業邁向生產建設之途，於四十六年七月一日成立台灣鳳林榮民肺結核療養院，委託台灣省衛生處代管，嗣因統一名稱于同年九月改用現名，並自四十七年七月一日起改隸直屬輔導委員會，斯時本院砂石遍地，殘垣破落，旋經全院院員工胼手胝足、流血流汗、辛苦創建、克難經營，歷經四十餘年逐步改善、充實設備，成為今日合格之地區綜合醫院。
本院創始之初，約佔地六．七八四○○公頃，均為簡陋房舍，經歷年改建，現有建築總面積九．八九八九公頃，為最新現代建築與設施，且符合環保標準之要求，並經衛生署評鑑合格，亦被指定為醫療網醫院之一，八十三年起以嶄新的編制十科六室（計為內科、外科、小兒科、婦產科、牙科、復健科、放射科、醫檢科、藥劑科、護理科，及醫務企管室、秘書室、輔導社會工作室、人事室、會計室、政風室）八十四年三月一日全民健保開辦時，本院立即承辦此一醫療作業，為花東地區榮民、榮眷及全民服務。
又本院於七十五年五月廿四日奉輔導會指示,特於台東榮民服務處開設榮民診所，並於七十八年二月一日正式作業，至七十九年六月廿九日奉行政院核定興建台東分院，即於台東榮民服務處旁興建醫療門診大樓一棟（內含一般病床四○床）八十二年底完工，八十三年元月廿三日由前主委周世斌將軍暨饒立委穎奇共同剪彩開幕（初編計有內科、外科、藥局、檢驗、護理、醫務、環保、社工、行政等十部門），八十五增建病房大樓完工啟用後，總床位開設至一○○床，並增設婦、兒、眼、牙等科，使其成為完善之地區綜合醫院，來為榮民、榮眷及民眾服務，以強化台東地區醫療資源，有效執行榮民就醫需要。
本院為配合政府政策，強化偏遠地區醫療資源，全體員工均凜於責任之重大，而時自惕厲，以其勿愧於所學，勿愧於民心，勿愧於職責，以本院一貫「求進步於艱困之時，求成功於苦難之中」的精神，盡心盡力、共同奮鬥，促使本院向現代化之地區綜合教學醫院目標邁進，優先服務榮民，改善服務態度，提高醫療水準，發揮愛心耐心，為本院一向服務榮民之精神，願我全體同仁切切牢記，貫徹執行，庶期勿負本院始建之宗旨。
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